La direction de l’institut est composée de représentants des différents groupes de l'Université de Bâle.

Le comité consultatif du CEPS conseille la direction scientifique de l'institut. L’organe est composé de représentants de SwissFoundations, des fondations fournissant des fonds de lancement et d'autres experts scientifiques et professionnels.

La formation continue du CEPS est confiée à une commission des programmes d’études qui s'acquitte de ses tâches dans le cadre du règlement sur la formation continue de l’Université de Bâle.  

Pr Michael Beckmann

Faculté des sciences économiques, Université de Bâle

Pr Manfred Max Bergman

Institut de sociologie, Université de Bâle

Pr Dr. Peter Jung

Faculté de droit, Université de Bâle

Pr Georg von Schnurbein

Directeur du CEPS

Maria Clotilde Henzen

Directrice des opérations du CEPS

Dr Suzanne Avedik

Directeur général adjoint de la Fondation Ernst Göhner, Membre du conseil d'administration de SwissFoundations

Pio Baltisberger

Directeur du département des finances de la Christoph Merian Stiftung

Dr Andrew Holland

Directeur de la Stiftung Mercator Schweiz

Prof Dr Karin Kreutzer

Professeur pour Social Business et directrice de l'Impact Institut, EBS University for Economics and Law

Markus Mader

conseiller stratégique du Secrétaire général adjoint de la IFRC

Pr Michael Meyer

Directeur de l’Institute for Nonprofit-Management, Wirtschaftsuniversität Wien

Pr Dr. Andrea Opel

Ordinaria pour le droit fiscal à l'Université de Lucerne

Dr Lukas von Orelli

Directeur de la Velux Stiftung, membre du comité directeur de SwissFoundations

Pr Adrian Ritz

Professeur en gestion d’entreprise du secteur public et Directeur général de compétence pour le management public de l’Université de Berne

Dr Pascale Vonmont

Directrice de la Gebert Rüf Stiftung